Wydział Chemiczny Polietchniki Warszawskiej

RAGE to zewnątrzkomórkowy receptor występujący na błonach różnorodnych komórek. W dojrzałym organizmie wykryto go m. in.: na komórkach śródbłonka naczyń krwionośnych, na monocytach oraz komórkach nerwowych. Spełnia on dużą rolę w znanych i często występujących w społeczeństwie chorobach (miażdżyca, cukrzyca, nowotwory, stany zapalne, choroby neurodegeneracyjne). Receptor RAGE 23 - 300 nie jest stabilny, gdyż posiada miejsca rozpoznawane przez powszechnie występujące proteazy. Stabilną formą jest natomiast mini domena RAGE 23 – 143, która w przyszłości będzie wykorzystana jako aktywna analitycznie warstwa w bioczujnikach elektrochemicznych do analizy obecności ligandów w płynach fizjologicznych. Przed zastosowaniem domeny RAGE 143 w bioczujnikach należy przebadać jej stabilność oraz powinowactwo do wybranych bioligandów. W tym celu wykorzystana zostanie metoda badań strukturalnych oparta na kinetyce wymiany wodór – deuter w białku sprzężona ze spektrometrią mas.
Proponowana praca obejmuje:
1. Optymalizację metody ekspresji w bakteriach E. coli rekombinowanego fragmentu 23 – 143 białka RAGE
2. Badanie struktury RAGE 143 z wykorzystaniem reakcji wymiany wodór – deuter sprzężonej ze spektrometrią mas (HDexMS)do wyznaczenia wiązania mini domeny 23 – 143 RAGE z peptydem Aβ.