Publikacja naukowców z Wydziału Chemicznego PW w International Journal of Biological Macromolecules

Zespół kierowany przez dr hab. inż. Małgorzatę Adamczyk, prof. Uczelni z Wydziału Chemicznego PW we współpracy z prof. Robertem Nowakiem z Wydziału Elektroniki i Technik Informacyjnych PW, opracował obiecujące, nowe podejście do badania modyfikacji tRNA przy użyciu sekwencjonowania Oxford Nanopore Sequencing (ONS) i sztucznej inteligencji. Te nowatorskie rozwiązania zostały przedstawione w artykule pt. 

Direct RNA Oxford Nanopore sequencing distinguishes between modifications in tRNA at the U34 position.

  
Chociaż ONS jest szeroko stosowane do badania mRNA, jego zastosowanie do transferowego RNA (tRNA), które przenosi aminokwasy podczas syntezy białek, nie było praktykowane ze względu na złożoność struktury i bogate modyfikacje tRNA. Po raz pierwszy wykazaliśmy, że nanopore rozróżnia złożone modyfikacje występujące na urydynie w pozycji 34 w tRNA. Tego typu modyfikacje odpowiadają za wierne odczytywanie mRNA podczas syntezy białek zarówno u organizmów modelowych jak i w komórkach ludzkich. W pracach badawczych uczestniczyła studentka Wydziału Chemicznego mgr Natalia Stróżyńska

  
Publikacja ukazała się w czasopiśmie International Journal of Biological Macromolecules (IJBM) o IF=8.5. 
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2025.145877

Została również wyróżniona na blogu RNA-seq Blog, w sekcji News».

   
Badania zostały sfinansowanie ze środków IDUB BIOTECHMED-3 Advanced

1. miejsce:

biotechnologia 

3. miejsce:

technologia chemiczna
  

   

 

 

 

Projekty z programu SZAFIR

  

   

YoungChem

   

   

 

Deklaracja dostępności